288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3723 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
329 aa  685    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  61.41 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  61.41 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  61.41 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  61.41 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  61.41 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  60.59 
 
 
333 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  62.3 
 
 
329 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  59.09 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  58.79 
 
 
337 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  59.09 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  60.26 
 
 
324 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  55.1 
 
 
324 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  54.81 
 
 
330 aa  362  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  56.09 
 
 
317 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 
329 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  39.2 
 
 
322 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  38.81 
 
 
345 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  42.21 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  40.4 
 
 
329 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  42.14 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  41.33 
 
 
338 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  39.6 
 
 
335 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  38.96 
 
 
331 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  38.96 
 
 
337 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  38.96 
 
 
331 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  36.47 
 
 
345 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  41.02 
 
 
302 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  38.76 
 
 
340 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
338 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  38.76 
 
 
340 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  38.19 
 
 
345 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  39.2 
 
 
330 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  42.35 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  37.84 
 
 
331 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
364 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  35.71 
 
 
638 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  33.68 
 
 
318 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
315 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
324 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  34.49 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
315 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  30.61 
 
 
320 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
323 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
314 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
314 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  30.87 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  29.18 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  32.91 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  29.51 
 
 
329 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  31.96 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
314 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
347 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  28.57 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  28.57 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
314 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
345 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  29.9 
 
 
344 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  32.6 
 
 
363 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  30.13 
 
 
330 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
317 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  30.13 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  30.58 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.31 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  26.22 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  26.22 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.3 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>