269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1860 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 329 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  61.84 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3419  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.516621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.15 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1899  lysophospholipase-like protein  33.18 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  28.52 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  39.84 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  36.5 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  25.37 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  36.84 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  36.84 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  27.8 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  41.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  38.79 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  38.79 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  32.31 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  35.48 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  36.56 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  24 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 284 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  23.21 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  36.56 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  29.85 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  39.25 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  23.4 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  31.45 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  31.25 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  24.88 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  23.4 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  23.38 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  30.56 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  31.39 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  30.48 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  30.77 
 
 		 279 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  22.42 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  31.67 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  23.62 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  23.27 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31.67 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>