57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12869 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  69.49 
 
 
346 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  67.76 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  67.76 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  67.76 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  68.21 
 
 
340 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  51.37 
 
 
398 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  50.92 
 
 
353 aa  279  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  47.43 
 
 
332 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.87 
 
 
321 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  42.99 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.47 
 
 
318 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  43.4 
 
 
345 aa  225  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.44 
 
 
316 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  42.55 
 
 
345 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
309 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  40.77 
 
 
339 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  37.99 
 
 
369 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  39.46 
 
 
335 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  38.74 
 
 
323 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.46 
 
 
345 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  36.67 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.74 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  37.5 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
341 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
332 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  32.87 
 
 
361 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  36.04 
 
 
336 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  37.88 
 
 
361 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 
337 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  37.19 
 
 
341 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
331 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  33.54 
 
 
335 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  34.22 
 
 
334 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  33.13 
 
 
354 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.89 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
320 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.93 
 
 
341 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
276 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  35.79 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.03 
 
 
277 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  21.88 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.96 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  18 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.96 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  30.67 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  29.33 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
559 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  21.79 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
279 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>