79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2582 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  48.28 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  49.04 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  48.12 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  47.47 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  45.81 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  45.57 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  44.16 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  47.19 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  46.27 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  47.47 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  42.99 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  46.45 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.41 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  43.91 
 
 		 353 aa  235  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  45.22 
 
 		 398 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  45.87 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  45.87 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  45.87 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  43.03 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  42.14 
 
 		 340 aa  231  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.43 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  43.87 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  44.09 
 
 		 361 aa  218  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.45 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  35.9 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  39.02 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  39.2 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  38.92 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.3 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  34.89 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  38.16 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  31.65 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  36.4 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  31.72 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  31.2 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  21.51 
 
 		 567 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  31.03 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  22.83 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  32.63 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  32.63 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  21.82 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  29.81 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  25.28 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  32.63 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  32.63 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  32.63 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  26.03 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.32 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>