64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2223 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  63.14 
 
 
341 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  47.29 
 
 
353 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  43.27 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  43.23 
 
 
340 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  41.69 
 
 
332 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  40.46 
 
 
336 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  40.85 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.62 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  41.27 
 
 
361 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  38.1 
 
 
398 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  39.78 
 
 
323 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
309 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  35.75 
 
 
332 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  35.9 
 
 
330 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  35.65 
 
 
340 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  35.65 
 
 
340 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  35.65 
 
 
340 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  34.71 
 
 
339 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  36.34 
 
 
353 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.75 
 
 
331 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  39.51 
 
 
346 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  34.66 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
335 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  32.95 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  35.26 
 
 
345 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  33.05 
 
 
321 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  32.87 
 
 
346 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  31.81 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
337 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  34.45 
 
 
340 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 
331 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  32 
 
 
316 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  32.85 
 
 
341 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  30.11 
 
 
354 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  36.04 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  28.81 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  31.34 
 
 
341 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  27.47 
 
 
278 aa  56.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  23.6 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  20.72 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.28 
 
 
253 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  34.43 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 
277 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
320 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  24.31 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.97 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.86 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  20.22 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
294 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.89 
 
 
301 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  29.41 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
306 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.45 
 
 
456 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
324 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25.22 
 
 
277 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>