More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0088 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  100 
 
 		 330 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  66.47 
 
 		 333 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  61.77 
 
 		 324 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  56.73 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  56.73 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  56.05 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  56.41 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  56.41 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  54.63 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  54.81 
 
 		 329 aa  362  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  50.32 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  52.85 
 
 		 329 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 		 317 aa  335  9e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  39.93 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  40 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  35.56 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  35.78 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  35.78 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  37.26 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  37.84 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  35.9 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  36.18 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  38.77 
 
 		 364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  36.54 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  34.95 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  36.24 
 
 		 638 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  34.19 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  34.31 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  33.56 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  34.67 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.45 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  32.34 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  30.47 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  31.92 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  27.74 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  30.43 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  31.37 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  29.14 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  31.12 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  30.6 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  29.55 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  28.03 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  26.78 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  26.74 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  25.55 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  33.81 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  27.94 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  23.62 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43400  predicted protein  25.74 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.21528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  25.36 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.18 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>