More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00537 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  100 
 
 		 322 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  45.92 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  40.81 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  41.69 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  40.68 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  39.02 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 		 324 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  40 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  34.8 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  35.87 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  34.97 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  35.91 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  34.98 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  34.98 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  34.76 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  34.98 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  34.76 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  34.98 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  34.98 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  36 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  34.78 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.44 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  33.64 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  34.08 
 
 		 638 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  33.12 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  36.47 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  32.31 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  31.25 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  30.61 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  31.48 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  30.33 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  31.67 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  30.43 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  29.21 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  29.21 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  29.9 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  28.75 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  31.16 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  28.34 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  27.52 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  27.68 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  29.1 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  27.95 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.66 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  23.75 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  23 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  23 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.13 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  23 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.56 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>