187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3995 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  100 
 
 
331 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  100 
 
 
337 aa  684    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  95.47 
 
 
331 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  71.91 
 
 
345 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  63.75 
 
 
330 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  62.89 
 
 
330 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  62.35 
 
 
345 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  61.21 
 
 
340 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  62.46 
 
 
345 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  57.88 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  57.88 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  57.88 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  57.88 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  58.28 
 
 
331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  57.88 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  40.66 
 
 
327 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
327 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 
327 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  40.3 
 
 
338 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 
324 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  41.43 
 
 
329 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  39.03 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  38.06 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  39.23 
 
 
337 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
329 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  38.66 
 
 
329 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  37.62 
 
 
333 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  40.37 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
324 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  34.97 
 
 
322 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  35.78 
 
 
330 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
329 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  34.76 
 
 
322 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  40.47 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  33.54 
 
 
638 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
364 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  37.03 
 
 
317 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  31.52 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
323 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 
345 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  26.75 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  32.54 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  30.2 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
314 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
314 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
314 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
314 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
303 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  30.07 
 
 
344 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
315 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
329 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
314 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
337 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
324 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  30.69 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  29.67 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  30.67 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  29.67 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  29.33 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  27.86 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  27.27 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  28.63 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.79 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  27 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  28.1 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  28.4 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.91 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.91 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>