269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0039 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 324 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  56.6 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  55.1 
 
 		 329 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  55.02 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  54.37 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  55.41 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  55.02 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  55.02 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  53.82 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  53.16 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  51.59 
 
 		 324 aa  348  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  50.32 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 317 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  37.99 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  37.99 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  38.96 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  38.96 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  38.32 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  39.44 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  38.16 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  35.37 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  34.32 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  35.18 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  36.48 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  36.04 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  34.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  34.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  34.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  34.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  34.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  33.55 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  32.17 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  32.48 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  33.11 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  34.32 
 
 		 638 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  31.91 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  29.27 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  28.96 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  32.27 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  29.22 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  29.43 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  30.14 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  30.63 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  29.64 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  26.82 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  25.08 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  25.62 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  27.71 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  26.06 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 594 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  25.96 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  24.51 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  23.26 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  23.19 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.36 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  25.34 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  23.49 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>