125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  100 
 
 
341 aa  672    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  38.69 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 
353 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  42.61 
 
 
332 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  38.87 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  39.02 
 
 
340 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  40.36 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  39.24 
 
 
345 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.06 
 
 
321 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  39.51 
 
 
340 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  42.07 
 
 
336 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  39.51 
 
 
340 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  39.51 
 
 
340 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
341 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  39.62 
 
 
398 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.99 
 
 
318 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  38.64 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  38.76 
 
 
361 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  35.56 
 
 
332 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.58 
 
 
335 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  36.25 
 
 
316 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  38.16 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  37.19 
 
 
346 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  36.79 
 
 
346 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.31 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  34.47 
 
 
339 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  32.85 
 
 
361 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  39.12 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  35.43 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  33 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  35.24 
 
 
340 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  30.84 
 
 
335 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.09 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  34.66 
 
 
331 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
320 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  31.64 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.36 
 
 
313 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  35.23 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.86 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  25.17 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  21.78 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  23.27 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
275 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  22.68 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  28.19 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  23.4 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
294 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  27.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
329 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  22.47 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  27.9 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  25.47 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
277 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  28.21 
 
 
274 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  22.14 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
364 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
263 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  27.05 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  24.81 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  24.81 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2739  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 
303 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.58 
 
 
253 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  21.8 
 
 
335 aa  46.2  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  21.69 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  24.46 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  24.46 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  24.46 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>