54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3558 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  88.08 
 
 
345 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  54.81 
 
 
321 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  52.88 
 
 
318 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  55.59 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  48.05 
 
 
316 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  48.28 
 
 
330 aa  291  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  50.94 
 
 
339 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.56 
 
 
331 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  49.22 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  46.18 
 
 
353 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  38.44 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  43.49 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  44.94 
 
 
345 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 
337 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  44.74 
 
 
398 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  44.51 
 
 
340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  44.51 
 
 
340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  44.51 
 
 
340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  42.68 
 
 
332 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  42.55 
 
 
346 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  43.81 
 
 
361 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  41.85 
 
 
340 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.63 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  41.42 
 
 
320 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  43.43 
 
 
340 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  42.68 
 
 
346 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
331 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
341 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  39.88 
 
 
354 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  37.12 
 
 
336 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 
332 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  34.66 
 
 
361 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  37.38 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  39.24 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  33.86 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.7 
 
 
313 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.67 
 
 
341 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  28.06 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  24.41 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  25.17 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  35 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2897  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
277 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  33.09 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  27.63 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  28.78 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
559 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
287 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>