79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1697 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  58.18 
 
 
398 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  51.66 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  51.66 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  51.66 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  51.54 
 
 
346 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  51.86 
 
 
340 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  51.55 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  47.47 
 
 
330 aa  268  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  47.43 
 
 
346 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 
309 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  45.62 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  43.25 
 
 
323 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.75 
 
 
321 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  43.26 
 
 
318 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  42.64 
 
 
339 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  43.99 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  42.68 
 
 
345 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.24 
 
 
316 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  43.34 
 
 
361 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  40.57 
 
 
369 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.88 
 
 
341 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  38.36 
 
 
340 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  35.75 
 
 
361 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  40.25 
 
 
337 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 
332 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  35.63 
 
 
336 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  32.32 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  39.71 
 
 
369 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  38.97 
 
 
331 aa  175  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.85 
 
 
331 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 
320 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.39 
 
 
313 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  32.82 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  36.81 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  35.56 
 
 
341 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  34.15 
 
 
354 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.23 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.15 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  24.65 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  27.81 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  31.3 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  34.04 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.62 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.35 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  38.04 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  38.04 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  38.04 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.37 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
326 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  21.15 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  19.24 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  25.58 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  20.87 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  29.25 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
559 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  37.33 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  34.65 
 
 
279 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  36.78 
 
 
343 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  22.18 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>