91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2115 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  66.25 
 
 
369 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  61.01 
 
 
353 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  54.06 
 
 
361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  43.23 
 
 
361 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  46.34 
 
 
341 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  47.34 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.08 
 
 
345 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  43.25 
 
 
336 aa  255  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  43.44 
 
 
369 aa  242  9e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  43.03 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
335 aa  238  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  43.77 
 
 
323 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.63 
 
 
321 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  44.15 
 
 
309 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  41.85 
 
 
345 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.48 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  41.14 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  42.06 
 
 
398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  38.36 
 
 
332 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  37.54 
 
 
335 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
337 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  40.81 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  40.81 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  40.81 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.7 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.62 
 
 
331 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  38.72 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  39.38 
 
 
346 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  36.67 
 
 
346 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  39.43 
 
 
331 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  39.69 
 
 
340 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  39.02 
 
 
341 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.12 
 
 
353 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.24 
 
 
313 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  31.97 
 
 
334 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  34.47 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
284 aa  59.7  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  26.06 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.15 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.32 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.91 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.91 
 
 
279 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  25.78 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
250 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  29.36 
 
 
278 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
291 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.17 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
591 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  24.15 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  30 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.2 
 
 
288 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
590 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  30.07 
 
 
277 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.46 
 
 
279 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  20.85 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  25 
 
 
586 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  36.36 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  36.78 
 
 
594 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  32.56 
 
 
586 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
270 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
296 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
567 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  29.25 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  29.25 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  32.18 
 
 
589 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>