172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4659 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  58.55 
 
 		 585 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  58.55 
 
 		 585 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  68.61 
 
 		 585 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  63.59 
 
 		 594 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  58.03 
 
 		 585 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 		 591 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  65.07 
 
 		 589 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  65.24 
 
 		 589 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  59.72 
 
 		 587 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  65.24 
 
 		 589 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  64.9 
 
 		 599 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  68.84 
 
 		 586 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  65.24 
 
 		 589 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  58.55 
 
 		 585 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  71.13 
 
 		 584 aa  810    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  60.65 
 
 		 586 aa  709    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  58.38 
 
 		 585 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  69.18 
 
 		 586 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  62.89 
 
 		 583 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  61.36 
 
 		 594 aa  747    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  64.9 
 
 		 599 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  59.9 
 
 		 587 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  54.78 
 
 		 578 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  56.82 
 
 		 585 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  58.38 
 
 		 585 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  57.91 
 
 		 585 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 590 aa  1194    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  59.9 
 
 		 587 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  49.31 
 
 		 580 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 		 567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  60.3 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  41.43 
 
 		 285 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02969  alpha/beta hydrolase  62.37 
 
 		 103 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 284 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  29.77 
 
 		 286 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 302 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 277 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 302 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 302 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 302 aa  91.3  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 289 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 306 aa  90.5  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.78 
 
 		 318 aa  90.5  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 294 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.09 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.09 
 
 		 279 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.09 
 
 		 279 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  24.47 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 279 aa  77  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  25.35 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.09 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.6 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 300 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.26 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  25.76 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  22.8 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  26.28 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  22.4 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.06 
 
 		 279 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 338 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  25 
 
 		 301 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  26.51 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>