235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2780 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  62.85 
 
 
578 aa  740    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1192    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  50.52 
 
 
585 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  52.83 
 
 
591 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 
589 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 
589 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 
589 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  51.21 
 
 
583 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  50.52 
 
 
594 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  51.12 
 
 
589 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  49.31 
 
 
590 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  49.22 
 
 
585 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 
599 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 
599 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  48.62 
 
 
585 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  48.71 
 
 
585 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  48.71 
 
 
585 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  48.71 
 
 
585 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  48.28 
 
 
585 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  48.71 
 
 
585 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  47.94 
 
 
594 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  48.89 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  47.41 
 
 
585 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  48.89 
 
 
586 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  48.7 
 
 
584 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  46.7 
 
 
587 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  46.88 
 
 
587 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  47.42 
 
 
586 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  46.88 
 
 
587 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
578 aa  520  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 
567 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 
332 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  38.85 
 
 
285 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
284 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
277 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02969  alpha/beta hydrolase  50.53 
 
 
103 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
289 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
288 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
290 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
275 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  30.04 
 
 
286 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
289 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.29 
 
 
291 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
290 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
302 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
313 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
281 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.42 
 
 
279 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
306 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
278 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  23.11 
 
 
277 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  22.68 
 
 
277 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  24.24 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.05 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  23.77 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  23.77 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  23.4 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
279 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  21.8 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
257 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  22.31 
 
 
253 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  24.45 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  25.19 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  24.54 
 
 
279 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.18 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  27.47 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 
250 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.99 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  25.18 
 
 
306 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
302 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
302 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  25.5 
 
 
322 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
303 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
254 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  25.16 
 
 
304 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
559 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  22.56 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  20.39 
 
 
263 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  22.13 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  20.56 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  22.54 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  26.89 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  24.63 
 
 
280 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  24.63 
 
 
280 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>