157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3081 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  64.9 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  64.9 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  54.36 
 
 		 594 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  68.33 
 
 		 586 aa  845    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  57.02 
 
 		 585 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  57.71 
 
 		 591 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  55.82 
 
 		 589 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  59.72 
 
 		 590 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  55.82 
 
 		 589 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  55.92 
 
 		 589 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  56.26 
 
 		 599 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  55.08 
 
 		 586 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  55.82 
 
 		 589 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  64.9 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  57.26 
 
 		 584 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  54.91 
 
 		 583 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  55.42 
 
 		 586 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  99.83 
 
 		 587 aa  1214    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  65.07 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  65.75 
 
 		 585 aa  801    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  65.92 
 
 		 585 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  99.83 
 
 		 587 aa  1214    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  56.26 
 
 		 599 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 587 aa  1215    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  65.07 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  65.07 
 
 		 585 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  52.83 
 
 		 594 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 		 578 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  46.7 
 
 		 580 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  53.5 
 
 		 332 aa  363  4e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  38.85 
 
 		 285 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02969  alpha/beta hydrolase  55.91 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 284 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 277 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.61 
 
 		 286 aa  98.2  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 289 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 289 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 294 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 290 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 275 aa  87.8  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 278 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 313 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 		 279 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  25 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 281 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25.87 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  24.1 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 328 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  22.05 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 302 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 302 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  24.48 
 
 		 306 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  22.63 
 
 		 276 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 280 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 280 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 254 aa  72  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  20.97 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  22.52 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  23.18 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  24.35 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  21.46 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  20.6 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  22.91 
 
 		 279 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  22.91 
 
 		 279 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 		 330 aa  67  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  20.24 
 
 		 253 aa  67  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  21.9 
 
 		 303 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  22.91 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  21.12 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  23.08 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  24.26 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.01 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 		 286 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>