More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5281 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  60.82 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  58.42 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  58.87 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  58.51 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  55.97 
 
 		 328 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  45.59 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  40.44 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  42.38 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31.87 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  37.37 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  36.08 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  31.47 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  37.63 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  36.08 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  35.43 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.74 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.74 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.74 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  35.04 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  36.57 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  38.35 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  36.57 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  36.49 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  34.54 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 		 315 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  34.39 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  34.39 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  34.39 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.97 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.74 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  35.04 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  28.85 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  28.85 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  28.79 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  28.4 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  28.79 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  28.85 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  28.85 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  28.4 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  35.09 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  30.5 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.67 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 594 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  36.18 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  28.4 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.05 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  33.74 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  36.87 
 
 		 559 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 594 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  25.09 
 
 		 313 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  28.9 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 589 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 589 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  30.97 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 578 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  29.93 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>