38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3838 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 
594 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 
590 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  41.84 
 
 
585 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
589 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
589 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 
589 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
591 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  41.11 
 
 
583 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  43.54 
 
 
586 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  40.49 
 
 
589 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
599 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
599 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
578 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  43.17 
 
 
586 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  38.85 
 
 
580 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  39.07 
 
 
594 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 
584 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  38.85 
 
 
587 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 
587 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  38.85 
 
 
587 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  38.24 
 
 
585 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  38.24 
 
 
585 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  37.87 
 
 
585 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  37.87 
 
 
585 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  37.87 
 
 
585 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  38.24 
 
 
585 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  38.24 
 
 
585 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  37.82 
 
 
585 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  39.53 
 
 
586 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  40.42 
 
 
332 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  39.35 
 
 
578 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
567 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1128  hypothetical protein  26.76 
 
 
312 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.31 
 
 
207 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>