237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0068 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 375 aa  729    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  49.22 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  49.38 
 
 		 341 aa  256  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  43.77 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1493  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  40.24 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  41.54 
 
 		 343 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  40.69 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2079  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0269256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  38.54 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.52 
 
 		 279 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.52 
 
 		 279 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.52 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.05 
 
 		 277 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  31.27 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  30.06 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.27 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.93 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.93 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 		 306 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.42 
 
 		 277 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.34 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.72 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  30.22 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.72 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  28.17 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  25.53 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  29.43 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  24.64 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  27.41 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.18 
 
 		 279 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  20.82 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  26.15 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  25.61 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2699  putative hydrolase  35.11 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  26.95 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  24.41 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  25.99 
 
 		 310 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  24.07 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34489  predicted protein  25.45 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.24 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  26.36 
 
 		 580 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  24.07 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  25.08 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  25.08 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  25.08 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  27.9 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  26.95 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  25.08 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.78 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>