132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3696 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 343 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3419  alpha/beta hydrolase fold  42.44 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.516621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.91 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7460  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.92 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1899  lysophospholipase-like protein  25.1 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  24.81 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  24.81 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  24.81 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 245 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  25.13 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  25 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  30.28 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  23.57 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.45 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  28.46 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  22.69 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  28.44 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  26.15 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.01 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  25.28 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  32.26 
 
 		 733 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  24.39 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1279  Lysophospholipase-like protein  27.89 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  32.14 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  23.98 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 273 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  25.95 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4084  chloride peroxidase  26.73 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 327 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  25.21 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  25.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  25.21 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  30.48 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  25.6 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.2 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  42.31 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  24.37 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  25.31 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  41.94 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>