94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1279 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1279  Lysophospholipase-like protein  100 
 
 
313 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.68 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  21.75 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  22.9 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  22.37 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
267 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  21.37 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  24.39 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  21.67 
 
 
272 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  21.43 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  21.43 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  21.65 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.59 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  21.34 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  21.34 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  21.34 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  21.34 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  20.92 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  23.25 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  23.25 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  23.25 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  21.07 
 
 
267 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  21.84 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  21.84 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  24.37 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  23.72 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  22.37 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  22.58 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  22.26 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  29.71 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  29.71 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  20.6 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  25.7 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  21.07 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  22.69 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  27.89 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.14 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.06 
 
 
2762 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  20.09 
 
 
245 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  22.81 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  30.37 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  20.63 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.21 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  26.78 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  22.39 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.36 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
352 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
275 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  25.35 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  25.57 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  24.41 
 
 
331 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  21.43 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  27.1 
 
 
233 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.5 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0631  alpha/beta fold family hydrolase  22.94 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  21.26 
 
 
586 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>