54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7460 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7460  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1899  lysophospholipase-like protein  35.76 
 
 
340 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.75 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  24.4 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  30.28 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.11 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3419  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.516621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  33.73 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
302 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  25.71 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  32.09 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  41.07 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  24.28 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  29.96 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  24.28 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  29.79 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  32.76 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  24.28 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  32.58 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  32.58 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  32.58 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  32.58 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  32.58 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  32.58 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  39.08 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  27.46 
 
 
343 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  26.72 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  31.46 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  31.62 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>