159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0304 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0304  lipase  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  88.31 
 
 		 333 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  87.99 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  86.69 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  68.37 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4857  hypothetical protein  67.95 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  66.24 
 
 		 316 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  63.69 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  61.46 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  60.83 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  58.33 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  47.49 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  35.96 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.78 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  36.63 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  31.93 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.38 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  26.19 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  29.75 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  27.2 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.76 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  25.97 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  25.97 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  26.36 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  26.36 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  26.36 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  26.64 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  26.64 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  26.36 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  24.71 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  38.74 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  26.02 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  25.87 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.3 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.3 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.31 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.69 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.27 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  32.56 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  27.63 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  33.33 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  23.72 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  31.69 
 
 		 505 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.11 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.36 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.89 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>