132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4857 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4857  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  90.06 
 
 		 356 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  66.99 
 
 		 333 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  67.2 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  67.31 
 
 		 308 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  67.95 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  66.35 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  61.15 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  60.9 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  58.47 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  57.83 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  42.71 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  34.92 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  25.87 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.7 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  33.66 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.38 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.38 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.2 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.38 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  28.19 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.15 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.6 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  30.66 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  33.63 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  35.64 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  32.71 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  31.48 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  32.41 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  30.56 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 559 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  32.41 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  32.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  28.93 
 
 		 541 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  33.03 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  34.34 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  30.56 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  27.07 
 
 		 523 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  29.61 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  31 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  22.35 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  28.21 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.25 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  26.76 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>