198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5393 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  67.73 
 
 
356 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4857  hypothetical protein  67.2 
 
 
313 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694232  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  66.24 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  64.63 
 
 
333 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  64.95 
 
 
308 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  64.31 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  58.28 
 
 
313 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  59.49 
 
 
313 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  58.15 
 
 
312 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  58.2 
 
 
339 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  44.19 
 
 
332 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
329 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  40.08 
 
 
346 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  27.85 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.22 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  31.84 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.43 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  29.39 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.22 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.51 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.98 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.59 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  32.18 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.2 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  32.18 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.2 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.2 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  34.86 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  28.76 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  37.23 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  38.38 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
559 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  38.38 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  38.3 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.79 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  29.2 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  36.17 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  27.4 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  29.27 
 
 
505 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
286 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  26.86 
 
 
491 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  23.05 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  21.31 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  29.29 
 
 
487 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  27.41 
 
 
541 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  29.69 
 
 
523 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  23.08 
 
 
322 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  20.58 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
253 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  22.98 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  27.61 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  28.36 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  30.23 
 
 
487 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  26.28 
 
 
493 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  21.67 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  29.92 
 
 
482 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>