160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5161 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  97.56 
 
 
328 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  91.88 
 
 
308 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  88.31 
 
 
308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  67.83 
 
 
356 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4857  hypothetical protein  66.99 
 
 
313 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694232  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  64.63 
 
 
316 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  61.78 
 
 
313 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  59.62 
 
 
312 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  60.83 
 
 
313 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  60.32 
 
 
339 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  47.1 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
329 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  38.55 
 
 
346 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
278 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.42 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  37.62 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.59 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  25.58 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  26.09 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  25.58 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  25.97 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  25.97 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  26.16 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
302 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
275 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  25.58 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  25.91 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  26.25 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  26.4 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  27.6 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
245 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
559 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  26.48 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  26.48 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  26.88 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  36.94 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 
257 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  27.64 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
250 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  28.31 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  30.07 
 
 
523 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
289 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
315 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
288 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  27.52 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  22.99 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.36 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  26.87 
 
 
541 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  26.24 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  27.06 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  31.51 
 
 
505 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.31 
 
 
286 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.44 
 
 
277 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  31.09 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  29.41 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>