149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0114 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  947    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  30.11 
 
 
398 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  32.02 
 
 
383 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  32.02 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  29.46 
 
 
411 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  28.86 
 
 
390 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  29.87 
 
 
397 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  30.63 
 
 
397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  30.12 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  29.65 
 
 
523 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  23.71 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  31.46 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  31.6 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  26.36 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  28.25 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  26.87 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  26.5 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  24.32 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  26.96 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  26.96 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  26.96 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  26 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  28.44 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  28.44 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  27.18 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  27.18 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  28.88 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  28.74 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  25.56 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  32.76 
 
 
488 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  27.97 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  29.89 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  27.67 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  27.54 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  26.54 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  25.55 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  26.1 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  27.8 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  32.19 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  26.73 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  37.37 
 
 
227 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  34.51 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  27.8 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
249 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  37.5 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  26.7 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  27.8 
 
 
247 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  33.33 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  26.69 
 
 
492 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  29.88 
 
 
271 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
292 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  32.2 
 
 
258 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  27.11 
 
 
257 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  31.39 
 
 
255 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  29.05 
 
 
255 aa  63.2  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  29.48 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  30.3 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25 
 
 
250 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  27.62 
 
 
252 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  32.76 
 
 
265 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
257 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  26.83 
 
 
247 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  33.67 
 
 
247 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  23.08 
 
 
269 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  25.12 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  36.84 
 
 
296 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.24 
 
 
736 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  34 
 
 
270 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  30.93 
 
 
246 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
278 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
258 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  26.5 
 
 
254 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  26.83 
 
 
256 aa  57  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.12 
 
 
253 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  30 
 
 
253 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
265 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
277 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
271 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.58 
 
 
736 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  24.56 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  25.11 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
230 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  28.87 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  26.76 
 
 
255 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  32.58 
 
 
303 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  25 
 
 
271 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  27.96 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  33.33 
 
 
265 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  24.8 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  30.91 
 
 
272 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  27.96 
 
 
271 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  28.46 
 
 
271 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  28.46 
 
 
273 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>