178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1512 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  100 
 
 		 481 aa  949    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  54.07 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  51.88 
 
 		 493 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  50.53 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  50.53 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  50.53 
 
 		 487 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  54.05 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  51.75 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  52.16 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  51.28 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  53.47 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  45.62 
 
 		 523 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  37.23 
 
 		 479 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  35.03 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  34.32 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  34.75 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  34.53 
 
 		 492 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  35.43 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  34.88 
 
 		 488 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  33.9 
 
 		 492 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  33.98 
 
 		 488 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  34.53 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  34.12 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  33.41 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  35.23 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  32.87 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  35.4 
 
 		 408 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  30.99 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  33.19 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  30.84 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  31.94 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  24.32 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  26.49 
 
 		 269 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  28.27 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  32.76 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  42.39 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  27.45 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  30.21 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  28.03 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  30.04 
 
 		 265 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  41.18 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  30.29 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  28.88 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  27.51 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  31.44 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  26.45 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  25.81 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  34.44 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  31.74 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.69 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  29.09 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 		 318 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 		 283 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 271 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  28.46 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  32.14 
 
 		 255 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  25.12 
 
 		 316 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  23.95 
 
 		 247 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  35.53 
 
 		 255 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 254 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  35.09 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  28.93 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.37 
 
 		 736 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.91 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  26.83 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.67 
 
 		 736 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  33.33 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 288 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 261 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 287 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  32.14 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 278 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 278 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  32.05 
 
 		 284 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 		 270 aa  50.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  29.59 
 
 		 315 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  24.65 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  32.11 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>