94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3337 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 345 aa  711    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  46.25 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  34.72 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  31.97 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  29.57 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  29.57 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  33.5 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  33.16 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  33.68 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  39.23 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  29.63 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  34.38 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  30.92 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  32.19 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  32.89 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  27.02 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  26.5 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  31.54 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  31.54 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  31.54 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  30.2 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  28.99 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1103  hypothetical protein  33.1 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149441  normal  0.0563263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  31.1 
 
 		 487 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  27.2 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  27.2 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  22.34 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  25.93 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  26.47 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  23.25 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  30.36 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  27.39 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  29.45 
 
 		 518 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  29.44 
 
 		 492 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  27.59 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  29.44 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  28.24 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  30.99 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  30 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  26.13 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  27.4 
 
 		 487 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  29.91 
 
 		 255 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  30.43 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  29.03 
 
 		 492 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  29.15 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  23.91 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  23.17 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  24.34 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  21.83 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  28.09 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  22.93 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  26.64 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3079  hypothetical protein  24.31 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  28.63 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  23.53 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  27.73 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  27.73 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  27.73 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 315 aa  46.2  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.66 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.11 
 
 		 736 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.84 
 
 		 736 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  27.07 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  23.85 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  29.8 
 
 		 733 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  27.78 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  31.3 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  26.56 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  27.59 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  23.98 
 
 		 238 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>