70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2244 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  86.63 
 
 		 408 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  76.58 
 
 		 492 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  75.76 
 
 		 492 aa  768    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  75.76 
 
 		 492 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  76.99 
 
 		 492 aa  782    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  94.05 
 
 		 488 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  97.54 
 
 		 488 aa  985    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1008    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  59.3 
 
 		 499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  56.44 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  58.51 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  54.84 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  56.29 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  52.7 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  50.29 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  37.04 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  36.93 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  36.89 
 
 		 487 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  36.89 
 
 		 487 aa  266  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  36.89 
 
 		 487 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  35.52 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  34.69 
 
 		 487 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  36.07 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  34.27 
 
 		 481 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  33.87 
 
 		 523 aa  237  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  34.66 
 
 		 491 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  34.04 
 
 		 505 aa  230  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  28.44 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  24.82 
 
 		 411 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  23.93 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  25.88 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  27.2 
 
 		 345 aa  57  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  26.94 
 
 		 733 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.36 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  27.23 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  21.16 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  32 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  32.22 
 
 		 254 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 258 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.35 
 
 		 736 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.35 
 
 		 736 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  25.91 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 283 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  24.7 
 
 		 257 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  23.97 
 
 		 265 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  29.46 
 
 		 257 aa  47  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  27.23 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  32.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  33.87 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  32.67 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  28.42 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  29.84 
 
 		 250 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  31.63 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  32.31 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  28.83 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  30.69 
 
 		 294 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  26.36 
 
 		 253 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 278 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>