175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3282 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  100 
 
 		 383 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  86.58 
 
 		 389 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  52.93 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  54.11 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  53.19 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  40.72 
 
 		 390 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  39.1 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  34.72 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  32.02 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  29.37 
 
 		 493 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  28.57 
 
 		 541 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  27.27 
 
 		 505 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  30.38 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  29.46 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  27.12 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  27.12 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  27.12 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  32.66 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  27.08 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  39.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  35 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  36.94 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  35 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  35 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  34.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  34.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  34.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  27.9 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  34.17 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  29.26 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.51 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  26.02 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  32.61 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.72 
 
 		 736 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  36.27 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  32.47 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  37.61 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  34.88 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  28.14 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  28.78 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  25.78 
 
 		 523 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  28.42 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  30.77 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  24.19 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.21 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  31.97 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  23.53 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  23.53 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  32.35 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  30.46 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  27.24 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  25.56 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  29.03 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  34.26 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  24.3 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  30.53 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  23.93 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  20.74 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  29.69 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  32.41 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  25.6 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  28.57 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  29.71 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  30.4 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  29.71 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  30.58 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  26.94 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  31.01 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  28.89 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  29.84 
 
 		 229 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  27.86 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  22.82 
 
 		 265 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  31.11 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  37.36 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  29.6 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  28.43 
 
 		 250 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  31.16 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  31.5 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 248 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 256 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  28.78 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  27.48 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>