74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1553 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  1005    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  52.15 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  51.95 
 
 		 525 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  54.13 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  53.11 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  52.58 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  52.37 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  52.16 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  52.7 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  52.28 
 
 		 479 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  52.16 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  52.49 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  49.7 
 
 		 499 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  47.57 
 
 		 518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  55.73 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  36.05 
 
 		 482 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  34.02 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  34.02 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  34.02 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  36.96 
 
 		 487 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  35.73 
 
 		 541 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  35.18 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  35.85 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  35.43 
 
 		 481 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  33.12 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  32.98 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  34.24 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  22.89 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.7 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25.32 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  27.24 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  28.38 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  30 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  34.4 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  29.9 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  34.19 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  25.21 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  25.11 
 
 		 250 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  29.15 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  30.08 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  28.22 
 
 		 733 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  23.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  33.61 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  31.52 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  32.95 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  30.85 
 
 		 294 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.91 
 
 		 250 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  24.02 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  30 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  26.39 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  31.25 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  31.76 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  28.1 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  39.36 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  31.76 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  30.36 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  32.94 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.06 
 
 		 290 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 257 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>