70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1760 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  100 
 
 
479 aa  985    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  60.12 
 
 
489 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  58.88 
 
 
488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  57 
 
 
492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  57 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  58.51 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  56.58 
 
 
492 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  56.04 
 
 
499 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  58.51 
 
 
488 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  56.38 
 
 
492 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  54.84 
 
 
525 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  57.47 
 
 
488 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  51.94 
 
 
518 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  52.28 
 
 
493 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  58.72 
 
 
408 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  40.52 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  40.52 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  40.52 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  39.21 
 
 
482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  39.35 
 
 
487 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  38.27 
 
 
541 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  37.42 
 
 
523 aa  287  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  37.61 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  36.6 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  38.59 
 
 
493 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  36.12 
 
 
491 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  33.69 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  31.46 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  26.85 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  22.77 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  25.56 
 
 
383 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  32.09 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  29.11 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  30.53 
 
 
389 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  33.6 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.78 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 
277 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  30.99 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.46 
 
 
250 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 
254 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 
249 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  34.44 
 
 
252 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  27.83 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
257 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  31.25 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  31.97 
 
 
257 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
265 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  26.02 
 
 
269 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  25.62 
 
 
262 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
281 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 
294 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 
294 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  27.47 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  30.69 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  27.72 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  25 
 
 
250 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
283 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  32.94 
 
 
257 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  31.82 
 
 
306 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  27.72 
 
 
294 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  29.79 
 
 
258 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  33.02 
 
 
733 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  22.43 
 
 
265 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  38.78 
 
 
254 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  29.55 
 
 
255 aa  43.5  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  27.35 
 
 
253 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
269 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>