63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1466 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1077    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  57 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  55.04 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  55.06 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  54.67 
 
 		 492 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  54.84 
 
 		 479 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  54.78 
 
 		 492 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  54.67 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  54.84 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  54.46 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  54.25 
 
 		 488 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  51.95 
 
 		 493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  49.9 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  46.78 
 
 		 518 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  55.56 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  37.02 
 
 		 482 aa  290  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  34.84 
 
 		 487 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  33.02 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  35.86 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  34.51 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  34.51 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  34.51 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  34.37 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  35.46 
 
 		 481 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  34.88 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  31.94 
 
 		 491 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  31.2 
 
 		 505 aa  206  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  29.89 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25.42 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  27.39 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  27.23 
 
 		 262 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 389 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 254 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  29.73 
 
 		 254 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  35.11 
 
 		 252 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 287 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 288 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 		 277 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  27.14 
 
 		 346 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.87 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 265 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  26.64 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  25.42 
 
 		 262 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.91 
 
 		 250 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  26.07 
 
 		 733 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  24.1 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  27.07 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  30.63 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  26.04 
 
 		 294 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  29.67 
 
 		 294 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 283 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 306 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.89 
 
 		 253 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  24.32 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  25.77 
 
 		 258 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>