106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1229 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  987    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  63.99 
 
 
487 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  58.91 
 
 
493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  59.08 
 
 
482 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  55.51 
 
 
487 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  55.51 
 
 
487 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  55.51 
 
 
487 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  51.86 
 
 
487 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  53.3 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  53.93 
 
 
541 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  52.37 
 
 
481 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  45.55 
 
 
523 aa  432  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  36.12 
 
 
479 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  34.62 
 
 
499 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  36.5 
 
 
492 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  36.5 
 
 
492 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  36.07 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  35.85 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  34.37 
 
 
488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  34.66 
 
 
488 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  34.11 
 
 
488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  33.82 
 
 
488 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  31.94 
 
 
525 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  32.62 
 
 
489 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  34.24 
 
 
493 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  30 
 
 
518 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  35.01 
 
 
408 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.87 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  27.9 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  23.98 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  31 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  25 
 
 
389 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
249 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  26.03 
 
 
269 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
265 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  34.23 
 
 
257 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.85 
 
 
250 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  26.57 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  28.43 
 
 
253 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  24.03 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  30.39 
 
 
270 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  26.86 
 
 
316 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
258 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  36.79 
 
 
253 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  30.66 
 
 
252 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  30.32 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  36.19 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  29.46 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  30.95 
 
 
257 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  35.79 
 
 
255 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
277 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  28.45 
 
 
258 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  29.38 
 
 
271 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  25.43 
 
 
255 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  25.81 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
254 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  27.05 
 
 
227 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  27.46 
 
 
265 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  33.67 
 
 
315 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  33.67 
 
 
315 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  24.86 
 
 
395 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  25.11 
 
 
313 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.06 
 
 
736 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  24.55 
 
 
316 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  39.29 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  33.72 
 
 
257 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  28.21 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  29 
 
 
254 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  28.81 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  29.57 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  29.52 
 
 
263 aa  47.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  28.09 
 
 
345 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  28.7 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  29.31 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 
261 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
259 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
299 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  28.7 
 
 
332 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.97 
 
 
736 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  32.29 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  31.3 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.45 
 
 
264 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  32.9 
 
 
265 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  24.22 
 
 
339 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  28.7 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  34.88 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  27.8 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
267 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
267 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  37.21 
 
 
296 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
274 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  29.17 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
343 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  28.37 
 
 
272 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  25 
 
 
250 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
277 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>