63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2436 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  85.89 
 
 
408 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  75.97 
 
 
492 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  93.02 
 
 
488 aa  933    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  94.05 
 
 
488 aa  946    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  74.95 
 
 
492 aa  770    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  75.15 
 
 
492 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  75.76 
 
 
492 aa  775    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  58.98 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  56.65 
 
 
489 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  55.04 
 
 
525 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  57.47 
 
 
479 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  56.94 
 
 
488 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  52.49 
 
 
493 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  50.78 
 
 
518 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  37.17 
 
 
487 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  37.2 
 
 
541 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  36.4 
 
 
482 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  36.94 
 
 
487 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  36.94 
 
 
487 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  36.94 
 
 
487 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  34.15 
 
 
487 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  36.07 
 
 
493 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  33.91 
 
 
481 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  34.01 
 
 
523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  33.76 
 
 
505 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  34.11 
 
 
491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  28.88 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  30.3 
 
 
390 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  24.46 
 
 
411 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  32.09 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  30.4 
 
 
383 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  27.65 
 
 
252 aa  57  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  29.89 
 
 
398 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.2 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.36 
 
 
250 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  28.57 
 
 
389 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 
254 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  28.12 
 
 
733 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
258 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
254 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  29.6 
 
 
397 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
281 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  29.47 
 
 
258 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  26.29 
 
 
269 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.91 
 
 
736 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  23.55 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  26.75 
 
 
316 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
283 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
249 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  29.84 
 
 
250 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  29.6 
 
 
257 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  30.3 
 
 
257 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  28.83 
 
 
265 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  28.97 
 
 
272 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
302 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
302 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  31.67 
 
 
302 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>