57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2024 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  837    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  85.89 
 
 		 488 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  86.63 
 
 		 488 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  86.63 
 
 		 488 aa  737    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  74.88 
 
 		 492 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  74.88 
 
 		 492 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  74.38 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  74.38 
 
 		 492 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  57.43 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  59.41 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  55.56 
 
 		 525 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  57.86 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  58.72 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  55.73 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  52 
 
 		 518 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  39.15 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  36.63 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  37.31 
 
 		 541 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  35.8 
 
 		 493 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  36.75 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  36.75 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  36.75 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  35.58 
 
 		 487 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  35.4 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  34.29 
 
 		 523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  35.29 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  35.01 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.54 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  29.2 
 
 		 733 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.1 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  25.88 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  27.27 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  29.6 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  27.2 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  35.87 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 254 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  29.77 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.78 
 
 		 736 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 277 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  31.25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  26.97 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  25.51 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 292 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  26.15 
 
 		 346 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  26.05 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>