64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0080 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  37.91 
 
 
316 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  36.88 
 
 
315 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  36.88 
 
 
315 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  34.72 
 
 
345 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  33.21 
 
 
346 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  36.84 
 
 
453 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  40.74 
 
 
397 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  32.35 
 
 
383 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  29.81 
 
 
389 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  33.91 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  28.22 
 
 
395 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  28.96 
 
 
411 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  38.68 
 
 
397 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  31.93 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  31.36 
 
 
487 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  31.36 
 
 
487 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  31.4 
 
 
482 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  31.36 
 
 
487 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  33.66 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
249 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  26.92 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  25.87 
 
 
398 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  21.08 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  29.53 
 
 
253 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  29.75 
 
 
493 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  24.37 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
240 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1186  hypothetical protein  31.01 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  30.36 
 
 
265 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
265 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  27.34 
 
 
255 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
254 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  33 
 
 
487 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  31.11 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.64 
 
 
736 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  28.93 
 
 
505 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  31.25 
 
 
523 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  29.9 
 
 
481 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 
254 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  28.57 
 
 
247 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  31.37 
 
 
541 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1187  hypothetical protein  30.39 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.809132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  29.13 
 
 
487 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  23.58 
 
 
499 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  25.27 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  33.33 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  28.85 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  31.03 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1005  hypothetical protein  28.18 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1753  hypothetical protein  22.06 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0781342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1311  hypothetical protein  27.42 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00216009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.63 
 
 
736 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  26.05 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  29.25 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  23.6 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  27.78 
 
 
227 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  27.27 
 
 
491 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  26.01 
 
 
271 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  32.22 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>