107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0015 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  994    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  72.43 
 
 
487 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  61.54 
 
 
482 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  61.78 
 
 
487 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  61.78 
 
 
487 aa  618  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  61.78 
 
 
487 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  59.88 
 
 
487 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  58.91 
 
 
491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  60.93 
 
 
541 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  53.02 
 
 
505 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  51.88 
 
 
481 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  48.41 
 
 
523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  37.27 
 
 
492 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  35.62 
 
 
488 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  37.06 
 
 
492 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  37.06 
 
 
492 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  38.59 
 
 
499 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  38.59 
 
 
479 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  36.65 
 
 
492 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  34.19 
 
 
489 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  36.45 
 
 
488 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  36.07 
 
 
488 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  36.07 
 
 
488 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  34.88 
 
 
525 aa  250  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  35.85 
 
 
493 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  33.4 
 
 
518 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  35.8 
 
 
408 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  29.37 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  28.57 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  26.43 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  25.56 
 
 
397 aa  77  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.5 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  24.73 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  31.88 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  25.42 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  26.74 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25.71 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
249 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  28.17 
 
 
252 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  35.16 
 
 
257 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
257 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  25.91 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  31.5 
 
 
257 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  28.84 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  28.44 
 
 
271 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
230 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.96 
 
 
250 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  27.23 
 
 
270 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  31.09 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.63 
 
 
736 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
288 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.14 
 
 
736 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  26.19 
 
 
253 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
258 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  24.89 
 
 
250 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  27.99 
 
 
733 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
265 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 
254 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  23.26 
 
 
346 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.87 
 
 
290 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  28.24 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  27.14 
 
 
262 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  29.82 
 
 
313 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  31.67 
 
 
253 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  35.29 
 
 
316 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
261 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  39.33 
 
 
265 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  26.28 
 
 
316 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  31.96 
 
 
315 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  34.74 
 
 
271 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  31.96 
 
 
315 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  37.21 
 
 
296 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  31.86 
 
 
255 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  30.83 
 
 
253 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
277 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
306 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
271 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  28.45 
 
 
257 aa  48.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  24.24 
 
 
255 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  30.7 
 
 
339 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  30.33 
 
 
262 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  35.23 
 
 
229 aa  47  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  29.2 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0080  hypothetical protein  29.75 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0184554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  25.12 
 
 
254 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
278 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  31.62 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  26.25 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  25.86 
 
 
308 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 
361 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  31.18 
 
 
407 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
280 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  28.87 
 
 
227 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
299 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  22.33 
 
 
246 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  22.33 
 
 
246 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>