113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0620 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  62.45 
 
 		 487 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  66.87 
 
 		 482 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  62.45 
 
 		 487 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  62.45 
 
 		 487 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  991    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  62.47 
 
 		 487 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  59.88 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  59.48 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  53.15 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  51.86 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  49.39 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  52.81 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  36.6 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  36.55 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  37.29 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  37.29 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  35.89 
 
 		 492 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  35.9 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  35.03 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  35.32 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  34.69 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  34.15 
 
 		 488 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  34.37 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  34.01 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  35.18 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  35.58 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  33.14 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  27.08 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  28.63 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  28.74 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  30.69 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  27.46 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  25.88 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25.68 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  28.96 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  31.11 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  31.3 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  28.5 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 254 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  30.43 
 
 		 346 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  27.82 
 
 		 267 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  29.32 
 
 		 267 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  28.5 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  35.83 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  33.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.72 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  27.07 
 
 		 272 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  27.07 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  27.07 
 
 		 277 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  30.23 
 
 		 316 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  27.07 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  27.07 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  27.07 
 
 		 267 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  45.65 
 
 		 254 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  33.9 
 
 		 254 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.31 
 
 		 290 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  27.4 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  38.2 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  29.63 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  29.17 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  32.29 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  28.46 
 
 		 339 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  27.78 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  28.17 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  30.83 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  27.64 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.58 
 
 		 736 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  28.28 
 
 		 263 aa  47.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  30.1 
 
 		 227 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1241  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  25.45 
 
 		 362 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.488852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  26.76 
 
 		 270 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 283 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  26.83 
 
 		 308 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  24.11 
 
 		 266 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  24.36 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  24.84 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.09 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>