56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2789 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1004    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  66.6 
 
 		 489 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  58.88 
 
 		 479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  57.46 
 
 		 492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  57.26 
 
 		 492 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  57.26 
 
 		 492 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  57.26 
 
 		 492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  57.14 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  56.29 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  56.29 
 
 		 488 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  54.05 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  54.45 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  54.13 
 
 		 493 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  48.94 
 
 		 518 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  57.86 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  36.68 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  35.62 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  36.98 
 
 		 541 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  35.89 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  34.25 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  34.25 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  34.25 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  35.03 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  34.89 
 
 		 523 aa  262  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  34 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  34.37 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  34.04 
 
 		 505 aa  236  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  33.14 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  26.02 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 389 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25.09 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  29.52 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  25.93 
 
 		 346 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  28.33 
 
 		 346 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  30.67 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  23.31 
 
 		 269 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  28.42 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  30.66 
 
 		 733 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  30.68 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 254 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  31.52 
 
 		 252 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  41.18 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.41 
 
 		 250 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  22.35 
 
 		 322 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  21.07 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>