More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3278 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  77.91 
 
 
249 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  41.67 
 
 
250 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  39.26 
 
 
254 aa  174  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  40.57 
 
 
265 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  40.84 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
254 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  41.95 
 
 
272 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  39.26 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  37.92 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  37.82 
 
 
255 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
257 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  39.48 
 
 
271 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  33.6 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  33.6 
 
 
246 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  33.6 
 
 
247 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  33.07 
 
 
262 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  34.92 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  32.02 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  32.41 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
313 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  31.8 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  33.05 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  34.76 
 
 
257 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  34.21 
 
 
257 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  31.43 
 
 
255 aa  119  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  30.17 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  30 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
248 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
298 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  32.24 
 
 
262 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  30.64 
 
 
250 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  28.87 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  28.87 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  29.05 
 
 
246 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
283 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
287 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 
288 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  29.13 
 
 
274 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
253 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  29.55 
 
 
255 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  30.27 
 
 
271 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  31.54 
 
 
266 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  27.31 
 
 
265 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  29.71 
 
 
238 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  26.83 
 
 
258 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  34.04 
 
 
257 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  28.69 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.29 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  28.21 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  29.67 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  30.7 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
306 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  35.32 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  29.88 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  31.64 
 
 
269 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  27.24 
 
 
306 aa  92  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  29.48 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.2 
 
 
736 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  28.51 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.8 
 
 
736 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  25.3 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  26.74 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  27.15 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  26.46 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  27.47 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  26.03 
 
 
733 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  24.6 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  24.6 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  24.6 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  33.5 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  25.38 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  25.38 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  26.7 
 
 
523 aa  75.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  30.3 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  27.42 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2020  carboxylesterase precursor  25.24 
 
 
207 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  22.98 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  22.98 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  22.98 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  27.19 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  23.08 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>