167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5529 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
278 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 
313 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  30.68 
 
 
265 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
306 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  32.85 
 
 
296 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  30.15 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  34.51 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
249 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
299 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  32.69 
 
 
274 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  32.43 
 
 
274 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30 
 
 
250 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  27.38 
 
 
262 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  27.76 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  29.64 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  29.64 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  29.64 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  28.52 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  27.59 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  28.35 
 
 
271 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  28.35 
 
 
271 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  28.35 
 
 
271 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  26.44 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  29.84 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  25.2 
 
 
227 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  28.34 
 
 
270 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  28.35 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
292 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  30.27 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  28.4 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0952  hypothetical protein  26.07 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.600635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  22.78 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  27.38 
 
 
407 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  28.52 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  25.19 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
287 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  26.34 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  28.12 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  28.98 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.69 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  27.51 
 
 
238 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  23.83 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  26.88 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  27.57 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  25.61 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0479  hypothetical protein  25.52 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000116996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0492  hypothetical protein  25.52 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000195032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  28.19 
 
 
733 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  35.19 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  23.48 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  23.85 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  22.92 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  22.87 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.77 
 
 
736 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  21.71 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  22.87 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  21.71 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  22.78 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  26.81 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  22.52 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  22.52 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  21.71 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  26.4 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  26.27 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0393  esterase/lipase-like protein  23.62 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.32 
 
 
736 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  27.04 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  21.62 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  32.52 
 
 
397 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  28.08 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  32.74 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  25.58 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  25.19 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  32.74 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  23.74 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  25.86 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  28.78 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  30.08 
 
 
397 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>