More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1914 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  83.04 
 
 
289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  48.18 
 
 
293 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
327 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
311 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  36.2 
 
 
327 aa  148  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
340 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
320 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
318 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
300 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
296 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.01 
 
 
298 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
329 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
297 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
297 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
304 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
299 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
300 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
343 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
321 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
300 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
342 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
421 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
342 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.37 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.16 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  29.04 
 
 
317 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
342 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  29.25 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
327 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
286 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  30 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  29.03 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  26.95 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.88 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  26.04 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  25.47 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  28.88 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.23 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  24.25 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  30.7 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  26.01 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.51 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.17 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1206  putative alpha/beta hydrolase superfamily  21.4 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1561  hypothetical protein  22.68 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.44 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  25.57 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  27.68 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  21.81 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>