55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2882 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
342 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 
342 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  66.89 
 
 
342 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  66.89 
 
 
343 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  66.56 
 
 
342 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 
322 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 
331 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 
329 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  47.39 
 
 
317 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  47.65 
 
 
317 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  50.34 
 
 
316 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
327 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  46.07 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 
321 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
293 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
289 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
327 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  27.97 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.56 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
329 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  24.9 
 
 
285 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.05 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  25.96 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  29.1 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
308 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
279 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  23.64 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.91 
 
 
562 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.59 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.3 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.4 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
332 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
332 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 
367 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>