58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1405 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  680    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  69.16 
 
 		 327 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  69.16 
 
 		 327 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  64.01 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 		 317 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  52.82 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  53.87 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  53.51 
 
 		 316 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  53.16 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  50.52 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.7 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  23.56 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  25.77 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 		 262 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.79 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  27.7 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.36 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  24.46 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 265 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  37.18 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>