125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0565 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 321 aa  634    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  40.67 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  36.39 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  36.77 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  37.19 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.85 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.78 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.44 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30.97 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  29.31 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  23.87 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  27.36 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.99 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.23 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.65 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 287 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.43 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  24.46 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  27.87 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>