41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1269 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  547  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  86.62 
 
 		 285 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1850  hypothetical protein  68.66 
 
 		 292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22546  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4102  hypothetical protein  68.79 
 
 		 284 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1668  hypothetical protein  67.52 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0390107  normal  0.64183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1571  hypothetical protein  74.01 
 
 		 228 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48041  normal  0.0731359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  39.63 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 342 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 342 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  22.75 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  25.85 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  33.17 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  25.53 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  38.66 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.55 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 		 327 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>