22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4102 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4102  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1850  hypothetical protein  75.97 
 
 
292 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22546  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1668  hypothetical protein  77.37 
 
 
290 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0390107  normal  0.64183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  68.79 
 
 
285 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  69.5 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1571  hypothetical protein  80.09 
 
 
228 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48041  normal  0.0731359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 
300 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  40.59 
 
 
288 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
318 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
284 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
299 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  33.78 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  32.69 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>