25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1668 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1668  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  564  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0390107  normal  0.64183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1850  hypothetical protein  88.32 
 
 
292 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22546  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1571  hypothetical protein  92.51 
 
 
228 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48041  normal  0.0731359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4102  hypothetical protein  76.95 
 
 
284 aa  377  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  67.14 
 
 
285 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  69.26 
 
 
285 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  42.91 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
327 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3656  putative hydrolase  34.33 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
287 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  34.59 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
299 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
251 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>